Why Does TNA Cross-Pair More Strongly with RNA Than with DNA? An Answer From X-ray Analysis

Authors


  • Financial support from the National Institutes of Health (Grant GM55237 to M.E.) is gratefully acknowledged. Parts of this work were performed at the DuPont-Northwestern-Dow Collaborative Access Team (DND-CAT) Synchrotron Research Center located at Sector 5 of the Advanced Photon Source, Argonne, IL (USA). DND-CAT is supported by the E. I. DuPont de Nemours & Co., The Dow Chemical Company, the U.S. National Science Foundation through Grant DMR-9304725, and the State of Illinois through the Department of Commerce and the Board of Higher Education Grant IBHE HECA NWU 96.

Abstract

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In DNA-Duplexen nehmen L-α-Threofuranosyl(3′→2′)-Nucleinsäure(TNA)-Einheiten stets eine gefaltete C4′-exo-Konformation ein, gleich ob sie in A- oder B-DNA-Duplexe eingebaut werden. Es resultiert ein P⋅⋅⋅P-Intranucleotidabstand, der dem Abstand in RNA (im Bild repräsentiert durch ein C3′-endo-gefaltetes Adenosin (grüne dünne Linien)) stark ähnelt. Die Strukturdaten liefern eine Erklärung für frühere Befunde, wonach TNA-Hybride mit RNA stabiler sind als solche mit DNA und RNA das bessere Templat für die Ligation von TNA-Fragmenten bereitstellt.

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