Advertisement

De Novo Folding of the DNA-Binding ATF-2 Zinc Finger Motif in an All-Atom Free-Energy Forcefield

Authors


  • This work was funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (WE 1863/10-2) and the Bode Foundation. We acknowledge the use of the computational facilities of the KIST Supercomputational Materials Lab.

Abstract

original image

Fingerübung: Die richtige Vorhersage einer All-Atom-Faltung eines DNA-bindenden αββ-Zinkfingermotivs in einem Gibbs-Energie-Kraftfeld wurde demonstriert (die drei farblich unterschiedenen Modelle zeigen die energieärmsten in der Simulation gefundenen Strukturen). Die niederenergetische Region der Gibbs-Energie-Oberfläche und wichtige Schritte des Faltungsweges wurden analysiert, um die Zinkfingerbildung und -funktion aufzuklären.

Ancillary