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Keywords:

  • DNA;
  • Glycoside;
  • Molekulare Erkennung;
  • Moleküldynamik
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Ein empfindliches Protein: Der Vergleich der Dissoziationskonstanten und Moleküldynamikschnappschüsse einer Reihe synthetischer telomerer doppelsträngiger DNA-Sequenzen mit HMdU-O-Glycosiden ergab, dass das DNA-bindende Protein von Kinetoplastiden wie Leishmania und Trypanosoma, JBP1, eine kritische Edge-on-Konformation des Pyranosylrings von Base J erkennt. Wenn diese Konformation gestört ist, nimmt die JBP1-Bindung drastisch ab.