Identification of Aggregation-Prone Elements by Using Interaction-Energy Matrices

Authors


  • This research was supported by the NSF (Postdoctoral Fellowship in Biological Sciences, J.M.B.), the Hughes Hall Fellowship, the University of Cambridge (J.M.B.), and the Medical Research Council (J.G.). We are grateful to Dr. P. Tessier and Dr. S. Lindquist for providing fluorescence intensities, and to Dr. C. M. Dobson and Dr. S. Radford for critical reading of the manuscript.

Abstract

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Zahlreiche Krankheitsbilder werden mit der Umwandlung löslicher Proteine in Amyloidaggregate in Verbindung gebracht. Die Peptidwechselwirkungsmatrix-Analyse, ein neues First-Principles-Rechenverfahren, identifiziert zur Aggregation neigende Peptide, die antiparallele (siehe Bild) oder parallele β-Faltblattbereiche bilden, und gibt Auskunft über die Wahrscheinlichkeit einer (Co)Aggregation.

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