Isotope-Coded Affinity Tags with Tunable Reactivities for Protein Footprinting

Authors


  • This research was supported by the NIH (GM55984). E.S.U. thanks the Molecular Biosciences Training Grant for support (GM07215). We thank R. E. Grant for synthetic assistance and Dr. E. E. Carlson for helpful discussions.

Abstract

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Empfindlich: Isotopencodierte Affinitätsmarker (ICATs) sind vielseitige Sonden zur Untersuchung von dynamischen Proteinstrukturen (Footprinting). Um ein effektives Testsystem zu erhalten, wurde eine Serie von ICAT-Reagentien entworfen (siehe Bild), deren Alkylierungsgeschwindigkeiten fünf Größenordnungen überspannen. Mit ihnen konnte eine beispiellose Auswahl von Cys-Resten aufgespürt werden, darunter auch solche, die tief im Proteinkern vergraben und an moderat affinen Protein-Protein-Wechselwirkungen beteiligt sind.

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