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Secondary-Structure-Inducible Ligand Fluorescence Coupled with PCR

Authors


  • We thank Prof. K. Yamana and Dr. M. Nakamura of University of Hyogo for fluorescence lifetime measurements. This work was supported by a Grant in Aid for Scientific Research (S) (18105006) from JSPS.

Abstract

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Haarnadel-Sekundärstrukturen am 5′-Ende eines PCR-Primers gehen im Lauf der PCR in eine Doppelstrangform über. DANP-Farbstoffmoleküle können an die Cytosin-Ausbuchtung (C-bulge) der Haarnadelstrukturen binden und ihre charakteristische Fluoreszenz abgeben. Wird ein PCR-Primer mit C-bulge-Haarnadel-Markierung in Gegenwart von DANP verwendet, so nimmt die Fluoreszenz des DANP-C-bulge-Komplexes ab, während die PCR fortschreitet.

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