DNA as a Molecular Ruler: Interrogation of a Tandem SH2 Domain with Self-Assembled, Bivalent DNA–Peptide Complexes

Authors

  • Hendrik Eberhard,

    1. Department of Chemistry, Humboldt University Berlin, Brook-Taylor-Strasse 2, 12489 Berlin (Germany), Fax: (+49) 30-2093-7266
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  • Franziska Diezmann,

    1. Department of Chemistry, Humboldt University Berlin, Brook-Taylor-Strasse 2, 12489 Berlin (Germany), Fax: (+49) 30-2093-7266
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  • Prof. Dr. Oliver Seitz

    Corresponding author
    1. Department of Chemistry, Humboldt University Berlin, Brook-Taylor-Strasse 2, 12489 Berlin (Germany), Fax: (+49) 30-2093-7266
    • Department of Chemistry, Humboldt University Berlin, Brook-Taylor-Strasse 2, 12489 Berlin (Germany), Fax: (+49) 30-2093-7266
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  • This research was supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (SFB 765). We thank Prof. Dr. Gabriel Waksman, University College London, for providing plasmids for GST-Syk-tSH2 expression.

Abstract

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Sonde mit zwei Peptiden: Die Selbstorganisation von DNA-Komplexen ermöglicht die Präsentation von zwei Phosphopeptiden. Flexibilität und Abstand zwischen diesen Liganden lassen sich durch Wahl geeigneter DNA-Template einstellen. Ein räumliches Screening der Tandem-SH2-Domäne von Syk-Kinase mit diesen Sonden (siehe Bild) gab Hinweise auf zugängliche Anordnungen der beiden homologen Bindungstaschen und auf die Flexibilität des domänenverbindenden Proteinlinkers.

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