Using Side-Chain Aromatic Proton Chemical Shifts for a Quantitative Analysis of Protein Structures

Authors

  • Aleksandr B. Sahakyan,

    1. Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW (UK)
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  • Dr. Wim F. Vranken,

    1. European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge CB10 1SD (UK)
    2. Current Address: Structural Biology Brussels, Vrije Universiteit Brussel, Pleinlaan 2, 1050 Brussel (Belgium)
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  • Dr. Andrea Cavalli,

    1. Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW (UK)
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  • Prof. Michele Vendruscolo

    Corresponding author
    1. Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW (UK)
    • Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW (UK)
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  • This research was supported by the Herchel Smith Foundation, the Leverhulme Trust, EMBO, the BBSRC, the Royal Society, and the EU eNMR project no. 213010.

Abstract

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Vorhersage chemischer Verschiebungen: Mit der hier vorgestellten strukturbasierten Vorhersage der 1H-NMR-Verschiebungen aromatischer Seitenketten von Proteinen können Unterschiede in röntgenkristallographisch und NMR-spektroskopisch bestimmten Strukturen identifiziert werden (siehe Bild; blaue Strukturen: aromatische Seitenketten, rote Kugeln: Wasserstoffatome an Aromaten). Solche Unterschiede können durch die Bindung von Cofaktoren oder Liganden verursacht sein oder durch Unterschiede in den Sequenzen.

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