Enzymatically Incorporated Genomic Tags for Optical Mapping of DNA-Binding Proteins

Authors


  • This work was supported by the UCLA-DOE Institute for Genomics and Proteomics (Grant DE-FC02-02ER63421) and NIH Grant R01-GM069709. A.G. and E.W. thank Prof. Dr. Michalis Kokkinidis for providing M.BseCI and the German Science Foundation (WE 1453/4-1 and 4-2) for financial support. Y.E. thanks the Legacy Heritage fund program of the Israel Science Foundation for financial support.

Abstract

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Ein Fluoreszenzmuster vom Genom des T7-Bakteriophagen wurde mithilfe einer sequenzspezifischen methyltransferaseinduzierten DNA-Markierung („SMILing DNA“) erzeugt (siehe Bild). Das Muster wird als ein linearer optischer Strichcode visualisiert, der die Lokalisierung individueller DNA-gebundener RNA-Polymerasen zeigt. Die Präzision der Messung bietet neue Möglichkeiten für die Genomforschung auf Einzelmolekülebene.

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