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Single-Molecule Approach to DNA Minor-Groove Association Dynamics

Authors

  • Jorge Bordello,

    1. Departamento de Química Física, Universidade de Santiago de Compostela, Facultade de Ciencias, 27001 Lugo (Spain)
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  • Mateo I. Sánchez,

    1. Departamento de Química Orgánica y Centro Singular de Investigación en Química Biológica y Materiales Moleculares, Unidad Asociada al CSIC, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Santiago de Compostela (Spain)
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  • Prof. Dr. M. Eugenio Vázquez,

    1. Departamento de Química Orgánica y Centro Singular de Investigación en Química Biológica y Materiales Moleculares, Unidad Asociada al CSIC, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Santiago de Compostela (Spain)
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  • Prof. Dr. José L. Mascareñas,

    1. Departamento de Química Orgánica y Centro Singular de Investigación en Química Biológica y Materiales Moleculares, Unidad Asociada al CSIC, Universidade de Santiago de Compostela, 15782 Santiago de Compostela (Spain)
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  • Prof. Dr. Wajih Al-Soufi,

    1. Departamento de Química Física, Universidade de Santiago de Compostela, Facultade de Ciencias, 27001 Lugo (Spain)
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  • Prof. Dr. Mercedes Novo

    Corresponding author
    1. Departamento de Química Física, Universidade de Santiago de Compostela, Facultade de Ciencias, 27001 Lugo (Spain)
    • Departamento de Química Física, Universidade de Santiago de Compostela, Facultade de Ciencias, 27001 Lugo (Spain)
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  • We thank the Ministerio de Ciencia e Innovación (CTQ2010-21369, SAF2007-61015, SAF2010-20822-C02, CTQ2009-14431/BQU, Consolider Ingenio 2010 CSD2007-00006) and the Xunta de Galicia (INCITE09262304PR, INCITE09E2R209064ES, IN845B-2010/094, INCITE09 209 084PR, GRC2010/12, PGIDIT08CSA-047209PR) for financial support. J.B. and M.I.S thank the Ministerio de Ciencia e Innovación for their research scholarships.

Abstract

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Spezielle Stelle: Fluoreszenzkorrelationsspektroskopischen Studien zufolge verläuft der Assoziationsprozess des in der kleiner Furche bindenden Bisbenzamidins BBA-OG (blauer Strich mit grünem Stern, siehe Schema) an dsDNA nicht diffusionskontrolliert, sondern durch Einschieben in eine bestimmte Stelle der Furche (rot), was die Geschwindigkeitskonstanten für jeden einzelnen Schritt des Bindeprozesses bestätigen.

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