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Ligand- and pH-Induced Conformational Changes of RNA Domain Helix 69 Revealed by 2-Aminopurine Fluorescence

Authors


  • We thank D. Rueda for providing access to the fluorometer. This project was supported by the NIH (GM087596).

Abstract

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Schleifenkonformation: Die Schleife der RNA-Domäne Helix-69 (H69) wurde mit dem fluoreszierenden Adenin-Analogon 2-Aminopurin (2AP) modifiziert, was die je nach den Bedingungen unterschiedlichen Konformationszustände sichtbar machte. Die Verwendung dieser Modell-RNA zeigt den besonderen Einfluss des Aminoglycosids Neomycin auf die Schleifenkonformation von H69, der sich von dem der strukturell ähnlichen Verbindungen Paromomycin und Gentamicin unterscheidet (siehe Bild).

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