Contaminated normal modeling with application to microarray data analysis

Authors


Abstract

A contaminated beta model equation image is often used to describe the distribution of equation image-values arising from a microarray experiment. The authors propose and examine a different approach: namely, using a contaminated normal model equation image to describe the distribution of equation image statistics or suitably transformed equation image statistics. The authors then address whether a researcher who has equation image statistics should analyze them using the contaminated normal model or whether the equation image statistics should be converted to equation image-values to be analyzed using the contaminated beta model. The authors also provide a decision-theoretic perspective on the analysis of equation image statistics. The Canadian Journal of Statistics 38: 315–332; 2010 © 2010 Statistical Society of Canada

Abstract

Un modèle bêta contaminé equation image est souvent utilisé pour décrire la fonction de répartition des seuils provenant d'une expérience sur les puces à ADN. Les auteurs proposent et étudient une approche différente : en particulier, l'utilisation d'un modèle normal contaminé equation image pour décrire la distribution des statistiques equation image ou des statistiques equation image transformées de façon adéquate. Par la suite, les auteurs s'intéressent à savoir si un chercheur qui utilise des statistiques equation image doit les analyser directement en utilisant un modèle normal contaminé ou les transformer en seuil et analyser ces derniers à l'aide d'un modèle bêta contaminé. Les auteurs proposent aussi une approche décisionnelle pour l'analyse des statistiques equation image. La revue canadienne de statistique 38: 315–332; 2010 © 2010 Société statistique du Canada

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