The Design of RNA Binders: Targeting the HIV Replication Cycle as a Case Study

Authors

  • Aurélie Blond,

    1. Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601, CNRS, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales, 45 Rue des Saints Pères, 75006 Paris (France)
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  • Dr. Eric Ennifar,

    Corresponding author
    1. Architecture et Réactivité de l'ARN, Université de Strasbourg, CNRS, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 Rue René Descartes, 67084 Strasbourg (France)
    • Eric Ennifar, Architecture et Réactivité de l'ARN, Université de Strasbourg, CNRS, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 Rue René Descartes, 67084 Strasbourg (France)===

      Carine Tisné, Cristallographie et RMN Biologiques, CNRS, Université Paris Descartes, 4 Avenue de l'Observatoire, 75006 Paris (France)===

      Laurent Micouin, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601, CNRS, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales, 45 Rue des Saints Pères, 75006 Paris (France)===

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  • Dr. Carine Tisné,

    Corresponding author
    1. Cristallographie et RMN Biologiques, CNRS, Université Paris Descartes, 4 Avenue de l'Observatoire, 75006 Paris (France)
    • Eric Ennifar, Architecture et Réactivité de l'ARN, Université de Strasbourg, CNRS, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 Rue René Descartes, 67084 Strasbourg (France)===

      Carine Tisné, Cristallographie et RMN Biologiques, CNRS, Université Paris Descartes, 4 Avenue de l'Observatoire, 75006 Paris (France)===

      Laurent Micouin, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601, CNRS, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales, 45 Rue des Saints Pères, 75006 Paris (France)===

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  • Dr. Laurent Micouin

    Corresponding author
    1. Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601, CNRS, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales, 45 Rue des Saints Pères, 75006 Paris (France)
    • Eric Ennifar, Architecture et Réactivité de l'ARN, Université de Strasbourg, CNRS, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 Rue René Descartes, 67084 Strasbourg (France)===

      Carine Tisné, Cristallographie et RMN Biologiques, CNRS, Université Paris Descartes, 4 Avenue de l'Observatoire, 75006 Paris (France)===

      Laurent Micouin, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, UMR 8601, CNRS, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales, 45 Rue des Saints Pères, 75006 Paris (France)===

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Abstract

The human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) replication cycle is finely tuned with many important steps involving RNA–RNA or protein–RNA interactions, all of them being potential targets for the development of new antiviral compounds. This cycle can also be considered as a good benchmark for the evaluation of early-stage strategies aiming at designing drugs that bind to RNA, with the possibility to correlate in vitro activities with antiviral properties. In this review, we highlight different approaches developed to interfere with four important steps of the HIV-1 replication cycle: the early stage of reverse transcription, the transactivation of viral transcription, the nuclear export of partially spliced transcripts and the dimerization step.

Ancillary