Diagnostic performance and costs of Capilia TB for Mycobacterium tuberculosis complex identification from broth-based culture in Bangkok, Thailand

Authors


Corresponding Author Kimberly McCarthy, US Centers for Disease Control and Prevention, 1600 Clifton Road, MS-F-08, Atlanta, GA 30333, USA. Tel.: +1-404-639-5483; Fax: +1-404-639-1287; E-mail: KMccarthy3@cdc.gov

Summary

Objectives  Broth-based culture (BBC) systems are increasingly being used to detect Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) in resource-limited. We evaluated the performance, time to detection and cost of the Capilia TB identification test from broth cultures positive for acid-fast bacilli (AFB) in Thailand.

Methods  From October–December 2007, broth cultures that grew AFB from specimens submitted by district TB clinics to the Bangkok city laboratory were tested for MTBC using Capilia TB and standard biochemical tests. Isolates that were identified as MTBC by biochemical tests but not by Capilia TB underwent repeat testing using Capilia TB, Accuprobe (Gen-Probe, San Diego, CA, USA) and sequencing. Costs of time, labour, infrastructure and consumables for all procedures were measured.

Results  Of 247 isolates evaluated, the sensitivity of Capilia TB was 97% and its true specificity 100% compared with biochemical testing. The median time from specimen receipt to confirmed MTBC identification was 20 days (range 7–53 days) for Capilia TB and 45 days (range 35–79 days) for biochemical testing (< 0.01). Six isolates that were Capilia TB negative but positive by biochemical testing were confirmed as MTBC and mutations in the mpb64 gene were detected in all. The unit cost of using Capilia TB was 2.67 USD that of biochemical testing was 8.78 USD.

Conclusions  In Thailand, Capilia TB had acceptable sensitivity and specificity, was lower in cost and had shorter turn-around times. Laboratories investing in BBC should consider Capilia TB for identification of MTBC, after validation of performance in their setting.

Performance et coûts du test Capilia TB pour l’identification du complexe Mycobacterium tuberculosisà partir de culture liquide à Bangkok en Thaïlande

Objectifs:  Les méthodes basées sur les cultures liquides (BBC), sont de plus en plus utilisées pour la détection du complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC) dans les régions à faibles revenus. Nous avons évalué la performance, la durée pour la détection et le coût du test d’identification Capilia TB à partir de cultures liquides positives pour les bacilles acido-résistants en Thaïlande.

Méthodes:  D’octobre à décembre 2007, Les cultures liquides avec une croissance de bacilles acido-résistants (AFB) à partir d’échantillons soumis par les cliniques TB de districts au laboratoire de la ville de Bangkok ont été testés pour MTBC en utilisant Capilia TB et les tests biochimiques standards. Les isolats qui ont été identifiés comme MTBC par les tests biochimiques mais pas par Capilia TB ont été retestés par Capilia TB, par Accuprobe, et par séquençage. Les coûts en temps, main-d’œuvre, infrastructures et consommables pour toutes les procédures ont été mesurés.

Résultats:  Sur 247 isolats évalués, la sensibilité de Capilia TB était de 97% et sa vraie spécificité de 100% par rapport aux tests biochimiques. Le délai médian à partir de la réception du spécimen pour confirmer l’identification de MTB était de 20 jours (intervalle: 7-53 jours) pour Capilia TB et 45 jours (intervalle: 35-79 jours) pour les tests biochimiques (p < 0,01). Six isolats trouvés négatifs par Capilia TB mais positifs par les tests biochimiques ont été confirmés comme MTBC et des mutations dans le gène mpb64 ont été détectées dans tous les 6. Le coût unitaire de l’utilisation de Capilia TB était de 2,67 USD, celle des tests biochimiques était de USD 8,78.

Conclusions:  En Thaïlande, Capilia TB avait une sensibilité et une spécificité acceptables, était moins cher et avait un plus délais pour l’obtention de résultat. Les laboratoires investissant dans les BBC devraient envisager Capilia TB pour l’identification des MTBC, après validation de la performance localement.

Desempeño diagnóstico y costes del Capilia TB para la identificación del complejo Mycobacterium tuberculosis en cultivos realizados en caldo en Bangkok, Tailandia

Objetivos:  Los sistemas basados en cultivos realizados en caldo (CC) están siendo cada vez más utilizados para detectar el complejo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) en asentamientos con bajos ingresos. Hemos evaluado el desempeño, el tiempo hasta la detección y el coste de la prueba identificativa Capilia TB, para cultivos realizados en caldo, positivos para bacilos ácido resistentes (BAR), en Tailandia.

Métodos:  Entre Octubre-Diciembre 2007, los cultivos realizados en caldo en los que crecieron BAR a partir de especímenes enviados por clínicas distritales de TB al laboratorio de la ciudad de Bangkok, fueron analizados en busca de CMTB utilizando el Capilia TB así como pruebas bioquímicas estándar. Los aislados que fueron identificados como CMTB mediante las pruebas bioquímicas, pero no con el Capilia TB, fueron reanalizados utilizando el Capilia TB, el Accuprobe, y mediante secuenciación. Se midieron y calcularon los costes de tiempo, mano de obra, infraestructura, y consumibles para todos los procedimientos.

Resultados:  De 247 aislados evaluados, la sensibilidad del Capilia TB fue del 97%, y su verdadera especificidad del 100% comparada con las pruebas bioquímicas. El tiempo medio desde la recepción de los especímenes hasta la confirmación de la identificación de MTB fue de 20 días (rango, 7 - 53 días) para el Capilia TB, y de 45 días (rango, 35–79 días) para las pruebas bioquímicas (p < 0.01). Seis aislados que eran negativos por Capilia TB pero positivos con pruebas bioquímicas, fueron confirmados con CMTB y en todos ellos se detectaron mutaciones en el gen mpb64. El coste unitario al utilizar el Capilia TB fue USD 2.67, y el de las pruebas bioquímicas fue de USD 8.78.

Conclusiones:  En Tailandia, el Capilia TB tenía una sensibilidad y especificidad aceptables, siendo más barato y con un tiempo más corto hasta la obtención de resultados. Los laboratorios que estén invirtiendo en BBC deberían considerar la opción del Capilia TB para la identificación del CMTB, después validar su desempeño bajo las condiciones locales.

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