Nuclear microsatellite markers for the date palm (Phoenix dactylifera L.): characterization and utility across the genus Phoenix and in other palm genera

Authors

  • N. Billotte,

    Corresponding author
    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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  • N. Marseillac,

    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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  • P. Brottier,

    1. GENOSCOPE (Centre National de Séquençage), 2 rue Gaston Crémieux CP5706, 91057 Evry cedex, France,
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  • J.-L. Noyer,

    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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  • J.-P. Jacquemoud-Collet,

    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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  • C. Moreau,

    1. IRD (Institut de Recherche pour le Développement), UMR DGPC/DYNADIV, 911 Avenue Agropolis BP 64501, 34394 Montpellier Cedex 5, France
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  • T. Couvreur,

    1. IRD (Institut de Recherche pour le Développement), UMR DGPC/DYNADIV, 911 Avenue Agropolis BP 64501, 34394 Montpellier Cedex 5, France
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  • M.-H. Chevallier,

    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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  • J.-C. Pintaud,

    1. IRD (Institut de Recherche pour le Développement), UMR DGPC/DYNADIV, 911 Avenue Agropolis BP 64501, 34394 Montpellier Cedex 5, France
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  • A.-M. Risterucci

    1. CIRAD (Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), UMR 1096 Polymorphismes d’Intérêt Agronomique, TA 40/03 Avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France,
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N. Billotte. Fax: 33 4 67 61 71 83; E-mail: norbert.billotte@cirad.fr

Abstract

A (GA)n microsatellite-enriched library was constructed and 16 nuclear simple sequence repeat (SSR) loci were characterized in Phoenix dactylifera. Across-taxa amplification and genotyping tests showed the utility of most SSR markers in 11 other Phoenix species and the transferability of some of them in Elaeis guineensis, 11 species of Pritchardia, Pritchardiopsis jeanneneyi and six species of Astrocaryum. The first to be published for P. dactylifera, these new SSR resources are available for cultivar identification, pedigree analysis, germplasm diversity as well as genetic mapping studies.

Ancillary