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Population Viability Analysis with Species Occurrence Data from Museum Collections

Authors


email olav.skarpaas@nina.no

Abstract

Abstract: The most comprehensive data on many species come from scientific collections. Thus, we developed a method of population viability analysis (PVA) in which this type of occurrence data can be used. In contrast to classical PVA, our approach accounts for the inherent observation error in occurrence data and allows the estimation of the population parameters needed for viability analysis. We tested the sensitivity of the approach to spatial resolution of the data, length of the time series, sampling effort, and detection probability with simulated data and conducted PVAs for common, rare, and threatened species. We compared the results of these PVAs with results of standard method PVAs in which observation error is ignored. Our method provided realistic estimates of population growth terms and quasi-extinction risk in cases in which the standard method without observation error could not. For low values of any of the sampling variables we tested, precision decreased, and in some cases biased estimates resulted. The results of our PVAs with the example species were consistent with information in the literature on these species. Our approach may facilitate PVA for a wide range of species of conservation concern for which demographic data are lacking but occurrence data are readily available.

Abstract

Resumen: Los datos más completos sobre muchas especies provienen de colecciones científicas. Por lo tanto, desarrollamos un método de análisis de viabilidad poblacional (AVP) en el que se puede utilizar este tipo de datos de ocurrencia. En contraste con el AVP clásico, nuestro método toma en cuenta el error de observación inherente en los datos de ocurrencia y permite la estimación de los parámetros poblacionales requeridos para el análisis de viabilidad. Probamos la sensibilidad del método a la resolución espacial de los datos, la longitud de las series de tiempo, el esfuerzo de muestreo y la probabilidad de detección con datos simulados y realizamos AVP de especies comunes, raras y amenazadas. Comparamos los resultados de estos AVP con resultados de AVP realizados con métodos estándar en los que se ignora el error de observación. Nuestro método proporcionó estimaciones realistas del crecimiento poblacional y del riesgo de cuasi extinción en casos en que el método estándar sin error observación no lo hacía. Cuando había pocos datos para cualquiera de las variables de muestreo que probamos, la precisión decreció, y en algunos casos resultaron estimaciones sesgadas. Los resultados de nuestros AVP con las especies ejemplo fueron consistentes con información sobre estas especies en la literatura. Nuestro método puede facilitar AVP para un amplio rango de especies de interés para la conservación cuando se carece de datos demográficos pero se cuenta con datos de ocurrencia.

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