Variant screening of the RHD gene in a large cohort of subjects with D phenotype ambiguity: report of 17 novel rare alleles

Authors

  • Yann Fichou,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Cédric Le Maréchal,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Laurence Bryckaert,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Christine Guerry,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Caroline Bénech,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Isabelle Dupont,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Déborah Jamet,

    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
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  • Claude Férec,

    Corresponding author
    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
      Jian-Min Chen or Claude Férec, EFS-Bretagne, 46 rue Félix Le Dantec, 29218 Brest, France; e-mail: Jian-Min.Chen@univ-brest.fr or Claude.Ferec@univ-brest.fr.
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  • Jian-Min Chen

    Corresponding author
    1. From the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U613; Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé, Université de Bretagne Occidentale; and the Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, Centre Hospitalier Universitaire (CHU), Hôpital Morvan, Brest, France.
      Jian-Min Chen or Claude Férec, EFS-Bretagne, 46 rue Félix Le Dantec, 29218 Brest, France; e-mail: Jian-Min.Chen@univ-brest.fr or Claude.Ferec@univ-brest.fr.
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Errata

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  1. Errata: ERRATA Volume 52, Issue 8, 1842, Article first published online: 9 August 2012

  • Supported by the Etablissement Français du Sang (EFS)-Bretagne and the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), France.

Jian-Min Chen or Claude Férec, EFS-Bretagne, 46 rue Félix Le Dantec, 29218 Brest, France; e-mail: Jian-Min.Chen@univ-brest.fr or Claude.Ferec@univ-brest.fr.

Abstract

BACKGROUND: A considerable number of RHD alleles responsible for weak and partial D phenotypes have been identified over the past decade. Two particular concerns, namely, 1) that red blood cells of these phenotypes may cause anti-D immunization when transfused to D– recipients and 2) that serologic determination of these phenotypes is often doubtful, make genetic analysis of the RHD gene highly desirable.

STUDY DESIGN AND METHODS: Blood samples that displayed D phenotype ambiguity (as determined by serologic analyses) were collected from several sites of the Etablissement Français du Sang and subjected to RHD variant screening by means of a previously established denaturing high-performance liquid chromatography method followed by direct sequencing.

RESULTS: Systematic screening of the RHD coding sequences as well as the exon-intron boundaries identified DNA variants in 755 of the 806 samples analyzed. In particular, this resulted in the identification of 10 novel single-nucleotide substitutions and seven novel complex alleles.

CONCLUSION: This study further increased the already large repertoire of RHD allelic variants. Whereas most of the newly found variants are putative weak or partial D alleles, most of the complex alleles are readily understandable in the present phylogenetic model of RHD.

Ancillary