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Keywords:

  • multidrug resistance;
  • tuberculosis;
  • molecular characterisation;
  • China
  • multirésistance;
  • tuberculose;
  • caractérisation moléculaire;
  • Chine
  • multirresistencia;
  • tuberculosis;
  • caracterización molecular;
  • China

Abstract

Objective

To investigate the molecular characteristics of MDR and XDR strains circulating in Chongqing, China.

Methods

The drug target genes conferring for rifampicin (RIF), isoniazid (INH), ethambutol (EMB), ofloxacin (OFLX) and kanamycin (KAN) resistance were screened by DNA sequencing to determine the mutation frequencies in this area.

Results

Drug susceptibility of 208 MDR isolates revealed that 132 (63.46%) were resistant to streptomycin (SM), 96 (46.15%) to ethambutol (EMB), 51 (24.52%) to ofloxacin (OFLX), and 26 (12.50%) to kanamycin (KAN); six (2.88%) isolates had XDR profiles. In comparison with the drug susceptibility phenotype, the sensitivity of drug resistance by DNA sequencing was 91.83% for RIF, 87.50% for INH, 66.67% for EMB, 74.51% for OFLX and 53.85% for KAN resistance. 12.50% of EMB- and 1.27% of OFLX-susceptible isolates were harboured genetic mutations in embB and gyrA, respectively.

Conclusion

Our findings demonstrate that the hot-spot regions localised in rpoB, katG and inhA genes serve as excellent markers for the corresponding drug resistance, while EMB, OFLX or KAN drug-resistant TB cases may not be identifiable by scanning embB, gyrA, rrs and eis promoter in Chongqing, indicating that further studies on the drug resistance mechanisms of EMB, OFLX and KAN are urgently needed to elucidate the low sensitivity between genomic substitutions and drug-resistant phenotype.

Objectif

Investiguer les caractéristiques moléculaires des souches MDR et XDR circulant à Chongqing, en Chine.

Méthodes

Les gènes cibles des médicaments conférant la résistance à la rifampicine (RIF), l'isoniazide (INH), l’éthambutol (EMB), l'ofloxacine (OFLX) et la kanamycine (KAN) ont été criblés par séquençage de l’ADN pour déterminer les fréquences des mutations dans ces domaines.

Résultats

La sensibilité aux médicaments de 208 isolats MDR a révélé que 132 (63.46%) étaient résistants à la streptomycine (SM), 96 (46.15%) à l’éthambutol (EMB), 51 (24.52%) à l'ofloxacine (OFLX) et 26 (12.50%) à la kanamycine (KAN); 6 (2.88%) isolats présentaient des profils XDR. En comparaison avec le phénotype de sensibilité aux médicaments, la sensibilité de la détection de la résistance aux médicaments par séquençage de l’ADN était de 91.83% pour la RIF; 87.50% pour l’INH; 66.67% pour l’EMB; 74.51% pour l’OFLX et 53.85% pour la KAN. 12.50% des isolats sensibles à l’EMB et 1.27% des isolats sensibles à l’OFLX portaient des mutations génétiques dans embB et gyrA, respectivement.

Conclusion

Nos résultats démontrent que les domaines sensibles localisés dans les gènes rpoB, katG et inhA sont d'excellents marqueurs de la résistance aux médicaments correspondant, tandis que les cas de tuberculose pharmacorésistante à l’EMB, l’OFLX ou la KAN pourraient ne pas être identifiables par criblage des promoteurs embB, gyrA, rrs et eis à Chongqing, indiquant que d'autres études sur les mécanismes de résistance à EMB, OFLX et KAN sont urgemment nécessaires pour élucider la faible sensibilité entre les substitutions génomiques et les phénotypes de résistance aux médicaments.

Objetivo

Investigar las características moleculares de cepas multirresistentes (MDR) y extremadamente resistentes (XDR) que circulan en Chongqing, China.

Métodos

Se realizó un cribado de los genes que confieren resistencias a la rifampicina (RIF), isoniazida (INH), etambutol (EMB), ofloxacina (OFLX) y kanamicina (KAN) mediante secuenciación del ADN, para determinar las frecuencias de mutación en esta área.

Resultados

La susceptibilidad a antimicrobianos de los 208 aislados MDR demostró que 132 (63.46%) eran resistentes a estreptomicina (SM), 96 (46.15%) a etambutol (EMB), 51 (24.52%) a ofloxacina (OFLX), y 26 (12.50%) a kanamicina (KAN); 6 (2.88%) aislados tenían perfiles XDR. En comparación con el fenotipo de susceptibilidad a antimicrobianos, susceptibilidad a los medicamentos determinada mediante secuenciación del ADN era del 91.83% para RIF, 87.50% para INH, 66.67% para EMB, 74.51% para OFLX y 53.85% para KAN. Un 12.50% de los aislados EMB- y 1.27% de los aislados OFLX-susceptibles tenían mutaciones genéticas en embB y gyrA, respectivamente.

Conclusión

Nuestros hallazgos demuestran que las regiones con puntos calientes localizadas en los genes rpoB, katG y inhA sirven como unos excelentes marcadores de resistencia al antimicrobiano correspondiente, mientras que los casos de TB resistentes a EMB, OFLX o KAN podrían no ser identificables mediante un cribado de embB, gyrA, rrs y el promotor eis en Chongqing, indicando que se necesitan urgentemente más estudios sobre estos mecanismos de resistencia con el fin de esclarecer la poca sensibilidad entre sustituciones genómicas y el fenotipo resistente.