Chemische synthese eines phagenspezifischen DNA‐fragments*
Für die Nomenklatur der Nukleinsäurebausteine wird die Regel der IUPAC (Europ. J. Biochem. 15, 203 (1970)) verwendet. Zur besseren Übersicht wird aber nach dem Präfix d(=desoxy) auf die Klammer verzichtet, so daß nur die Hydroxylschutzgruppen in Klammern gesetzt sind. TPS wird zur Abkürzung von 2,4,6‐Triisopropylbenzolsulfonsäurechlorid verwendet. Eine A260‐Einheit weist die Nukleotidmenge auf, welche in 1 cm3 Lösungsmittel gelöst, in einer Quarzzelle der Schichtdicke 1 cm bei 260 nm gemessen, die Absorption 1 ergibt.
Abstract
deDie Synthese eines Decadesoxyribonukleotids wird beschrieben, dessen Basensequenz dA‐G‐A‐A‐A‐T‐A‐A‐A‐A im Minus‐Strang der DNA des Phagen ϕX 174 vorkommt. Mit Hilfe dieses synthetischen Primers sollen weitere Bereiche der DNA des Phagen ϕX 174 sequenziert werden. Das Decanukleotid wird nach der Methode von Khorana et al. aus den geschützten Nukleotidblöcken
d(MeOTr)bzA‐ibuG, dpbzA‐bzA(Ac), dpbzA‐T(Ac) und dpbzA‐bzA‐bzA‐bzA(Ac) unter Verwendung von TPS als Kondensationsmittel in drei Kondensationsschritten aufgebaut.
Abstract
enThe synthesis of the decadeoxyribonucleotide dA‐G‐A‐A‐A‐T‐A‐A‐A‐A corresponding to the minus strand fragment of ϕX 174 DNA is discribed. This synthetic primer should allow sequence determination of the adjacent region. The decanucleotide was prepared in three steps according to the method of Khorana et al., using the protected nucleotide blocks
d(MeOTr)bzA‐ibuG, dpbzA‐bzA(Ac), dpbzA‐T(Ac) and dpbzA‐bzA‐bzA‐bzA(Ac) as intermediates for condensation reactions in the presence of TPS.
Number of times cited: 9
- F. SANGER and A.R. COULSON, A Rapid Method for Determining Sequences in DNA by Primed Synthesis with DNA Polymerase, Molecular Biology, 10.1016/B978-0-12-131200-8.50040-X, (595-604), (1989).
- Herbert Schott, Chemische synthese eines mutagenen fragments der minus‐strang DNA des phagen ΦX 174, Die Makromolekulare Chemie, 180, 7, (1669-1679), (2003).
- Herbert Schott and Margarette Schwarz, Präprative isolierung von desoxiriboadenylsäuren aus hydrolysaten oxidierter heringsspermen-DNA, Journal of Chromatography A, 157, (197), (1978).
- F. Sanger, G. M. Air, B. G. Barrell, N. L. Brown, A. R. Coulson, J. C. Fiddes, C. A. Hutchison, P. M. Slocombe and M. Smith, Nucleotide sequence of bacteriophage φX174 DNA, Nature, 265, 5596, (687), (1977).
- John C. Fiddes, Nucleotide sequence of the intercistronic region between genes G and F in bacteriophage X174DNA, Journal of Molecular Biology, 107, 1, (1), (1976).
- John E. DONELSON, Bart G. BARRELL, H. Lee WEITH, Hans KÖSSEL and Herbert SCHOTT, The Use of Primed Synthesis by DNA Polymerase I to Study an Intercistronic Sequence of ΦX‐174 DNA, European Journal of Biochemistry, 58, 2, (383-395), (2008).
- G.M. Air, E.H. Blackburn, F. Sanger and A.R. Coulson, The nucleotide and amino acid sequences of the N (5′) terminal region of gene G of bacteriophage φX174, Journal of Molecular Biology, 96, 4, (703), (1975).
- F. Sanger and A.R. Coulson, A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase, Journal of Molecular Biology, 94, 3, (441), (1975).
- Franz Brandstetter, Herbert Schott and Ernst Bayer, , Die Makromolekulare Chemie, 176, 8, (2163-2175), (2003).




